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FICHE EXAMEN
PCR PANFONGIQUE ET SÉQUENÇAGE
Révisé le 08/02/2024 13:54:03
EXAMEN
Nom d'examenPCR PANFONGIQUE ET SÉQUENÇAGE
Structure concernéePFGM-PARASITOLOGIE MYCOLOGIE
Synonymes, Abréviations, mots clésRecherche de genomes fongiques
PCR fongiques
PCR ITS
PCR 18S
ADN 18S
Identification d'un champignon par Biologie Moléculaire
Identification d'un champignon par séquençage
Laboratoire exécutant
LABORATOIRE CHU DE NANCY
Responsable(s)Anne DEBOURGOGNE
ContactSecteur technique: 03 83 15 34 77
Biologiste : 03 83 65 62 19
Principales indicationsInfections fongiques invasives
Remarques particulières, renseignements cliniques (RC) ou utilesRC : Contexte immunodépression, signes radiologiques, traitement antifongique
Préparation du patientAucune
Interférences connuesMoisissures environnementales
CotationPCR Code N151
Séquençage Code N906
PRE ANALYTIQUE
Nature du prélèvementBiopsie, LCR, LBA, abcès, prélèvements profonds …SAUF prélèvements sanguins
EchantillonBiopsie, LCR, LBA, abcès, prélèvements profonds … SAUF prélèvements sanguins
Type de CONTENANT
x1Tube BD stérile EST™ Z (sans additif)
x1Flacon stérile
Quantité minimale de liquide biologique200 µL ou 50 mg si biopsie
Si biopsie, ajouter un peu d’eau stérile
Délai pré-analytique et conditions de transportTransport à température ambiante – Délai d’acheminement maximum < 72 h.
Si > 24h, conserver à 5 °C (+/- 3°C).
Autres examens réalisables sur ce prélèvement dans le respect des conditions pré-analytiques des examens ajoutésExamen mycologique standard
Pré traitement (à usage du laboratoire)conservation à + 5 °C +/-3°C
ANALYTIQUE
Délai de conservation de l'échantillon par le laboratoire pour ajout d'examen complémentaire ou réanalyseSi négatif : 1 mois
Si positif : 1 an
POST ANALYTIQUE
Délais de rendu des résultats1 semaine
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