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FICHE EXAMEN
PCR PANFONGIQUE ET SÉQUENÇAGE
Révisé le 05/03/2020 10:16:07
Examen
Nom d'examenPCR PANFONGIQUE ET SÉQUENÇAGE
Structure concernéePFGM (PARASITOLOGIE, MYCOLOGIE)
Synonymes, Abréviations, mots clésRecherche de genomes fongiques
PCR fongiques
PCR ITS
PCR 18S
ADN 18S
Identification d'un champignon par Biologie Moléculaire
Identification d'un champignon par séquençage
Laboratoire exécutant
LABORATOIRE CHU DE NANCY
Remarques particulières, renseignements cliniques (RC) ou utilesRC : Contexte immunodépression, signes radiologiques, traitement antifongique
Interférences connuesMoisissures environnementales
CotationPCR BHN 480 Code N151
Séquençage BHN340 Codes N906
Préparation du patientAucune
Principales indicationsInfections fongiques invasives
Responsable(s)Marie MACHOUART
PRE ANALYTIQUE
Nature du prélèvementBiopsie, LCR, LBA, abcès, prélèvements profonds …SAUF prélèvements sanguins
EchantillonBiopsie, LCR, LBA, abcès, prélèvements profonds … SAUF prélèvements sanguins
Type de contenant
x1Tube BD Vacutainer® EST™ sans additif
x1flacon stérile
Echantillon / Récipient dérogatoire
x1flacon stérile
Quantité minimale de liquide biologique200 µL ou 50 mg si biopsie
Si biopsie, ajouter un peu d’eau stérile
Délai pré-analytique et conditions de transportTransport à température ambiante – Délai d’acheminement maximum < 72 h.
Si > 24h, conserver à 5 °C (+/- 3°C).
Autres examens réalisables sur ce prélèvement dans le respect des conditions pré-analytiques des examens ajoutésExamen mycologique standard
ANALYTIQUE
Délai de conservation de l'échantillon par le laboratoire pour ajout d'examen complémentaire ou réanalyseSi négatif : 1 mois
Si positif : 1 an
POST ANALYTIQUE
Délais de rendu des résultats1 semaine
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