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FICHE EXAMEN
PCR PANFONGIQUE ET SÉQUENÇAGE
Révisé le 08/02/2024 13:54:03
Nom d'examen | PCR PANFONGIQUE ET SÉQUENÇAGE |
Structure concernée | PFGM-PARASITOLOGIE MYCOLOGIE |
Synonymes, Abréviations, mots clés | Recherche de genomes fongiques PCR fongiques PCR ITS PCR 18S ADN 18S Identification d'un champignon par Biologie Moléculaire Identification d'un champignon par séquençage |
Laboratoire exécutant | |
Responsable(s) | Anne DEBOURGOGNE |
Contact | Secteur technique: 03 83 15 34 77 Biologiste : 03 83 65 62 19 |
Principales indications | Infections fongiques invasives |
Remarques particulières, renseignements cliniques (RC) ou utiles | RC : Contexte immunodépression, signes radiologiques, traitement antifongique |
Préparation du patient | Aucune |
Interférences connues | Moisissures environnementales |
Cotation | PCR Code N151 Séquençage Code N906 |
Nature du prélèvement | Biopsie, LCR, LBA, abcès, prélèvements profonds …SAUF prélèvements sanguins |
Echantillon | Biopsie, LCR, LBA, abcès, prélèvements profonds … SAUF prélèvements sanguins |
Type de CONTENANT |
| x1 | Tube BD stérile EST™ Z (sans additif) | |
| x1 | Flacon stérile | |
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Quantité minimale de liquide biologique | 200 µL ou 50 mg si biopsie Si biopsie, ajouter un peu d’eau stérile |
Délai pré-analytique et conditions de transport | Transport à température ambiante – Délai d’acheminement maximum < 72 h. Si > 24h, conserver à 5 °C (+/- 3°C). |
Autres examens réalisables sur ce prélèvement dans le respect des conditions pré-analytiques des examens ajoutés | Examen mycologique standard |
Pré traitement (à usage du laboratoire) | conservation à + 5 °C +/-3°C |
Délai de conservation de l'échantillon par le laboratoire pour ajout d'examen complémentaire ou réanalyse | Si négatif : 1 mois Si positif : 1 an |
Délais de rendu des résultats | 1 semaine |
Référence : DRH FO MC 005 Version : 5 Date d'application : 13/12/2023 Approbateur : S.SALIGNAC- P.FRANCK Date d'approbation : 13/12/2023
"Seule la version électronique fait foi"